Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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