Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms