Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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NR1H3Q13133 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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NR1H3Q13133 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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NR1H3Q13133 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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NR1H3Q13133 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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