Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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