Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 FMP25YLR077W 1752 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 MNT4YNR059W 1743 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 SSF1YHR066W 1362 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 PUB1YNL016W 1362 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 RPL22AYLR061W 366 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 PKR1YMR123W 369 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YNL184CYNL184C 327 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 IRC16YPR038W 360 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 GAL11YOL051W 3246 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 VID27YNL212W 2349 nt3.53□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 MYO3YKL129C 3819 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 SEC6YIL068C 2418 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 NAT1YDL040C 2565 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YDR193WYDR193W 399 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 Q0092Q0092 141 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YIL054WYIL054W 318 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 GTT2YLL060C 702 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YLR294CYLR294C 330 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 JLP2YMR132C 627 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 RAD14YMR201C 1116 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YMR320WYMR320W 306 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YOR082CYOR082C 342 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 RPC40YPR110C 1008 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 RAD4YER162C 2265 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 NHX1YDR456W 1902 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 CHA4YLR098C 1947 nt3.52□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YKL050CYKL050C 2769 nt3.51□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 NDC80YIL144W 2076 nt3.51□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 ZDS2YML109W 2829 nt3.51□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 ECO1YFR027W 846 nt3.51□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YHL026CYHL026C 948 nt3.51□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YHI9YHR029C 885 nt3.51□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt3.51□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 SUI1YNL244C 327 nt3.51□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YBR209WYBR209W 318 nt3.51□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 ARC40YBR234C 1155 nt3.51□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 RNR1YER070W 2667 nt3.51□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 SPE1YKL184W 1401 nt3.51□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 MTC4YBR255W 2085 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 ABP140YOR239W 1887 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 SHS1YDL225W 1656 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 ATG2YNL242W 4779 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 RTR2YDR066C 591 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 CPR5YDR304C 678 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 PCL5YHR071W 690 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 MRPL38YKL170W 417 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YOR121CYOR121C 306 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 BFR1YOR198C 1413 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 FUN12YAL035W 3009 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 BI4Q0120 1917 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YLR177WYLR177W 1887 nt3.5□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 SMI1YGR229C 1518 nt3.49□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 SLK19YOR195W 2466 nt3.49□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 PMT6YGR199W 2280 nt3.49□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 KAR9YPL269W 1935 nt3.49□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 SDH7YDR511W 402 nt3.49□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 GRX2YDR513W 432 nt3.49□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt3.49□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YAL037WYAL037W 804 nt3.49□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 RMP1YLR145W 606 nt3.49□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YBR242WYBR242W 717 nt3.49□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YGL140CYGL140C 3660 nt3.49□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 PWP2YCR057C 2772 nt3.48□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YBR225WYBR225W 2703 nt3.48□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 HEF3YNL014W 3135 nt3.48□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 SPC19YDR201W 498 nt3.48□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 VOA1YGR106C 798 nt3.48□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 DFG10YIL049W 762 nt3.48□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 MBA1YBR185C 837 nt3.48□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 PSP1YDR505C 2526 nt3.48□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 MNR2YKL064W 2910 nt3.47□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 NUP2YLR335W 2163 nt3.47□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 THI13YDL244W 1023 nt3.47□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 RTT105YER104W 627 nt3.47□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 TCD1YHR003C 1290 nt3.47□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YJR111CYJR111C 852 nt3.47□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 ADI1YMR009W 540 nt3.47□□□□□ -1.85
MSL5Q12186 YOP1YPR028W 543 nt3.47□□□□□ -1.85 RIP-Chip
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.2 ms