Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms