Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL16A1Q07092 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms