Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD51Q06609 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms