Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms