Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms