Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms