Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP1Q04837 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms