Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	SLU7	YDR088C	1149 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	PAU14	YIL176C	363 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	PAU1	YJL223C	363 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	NDL1	YLR254C	570 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YPT6	YLR262C	648 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	BUD21	YOR078W	645 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YBR300C	YBR300C	498 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	MET5	YJR137C	4329 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YNL193W	YNL193W	1677 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	BRE5	YNR051C	1548 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	PUF6	YDR496C	1971 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	STE11	YLR362W	2154 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	snR83	snR83	306 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	ERG28	YER044C	447 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	RRT13	YER066W	558 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YFL012W	YFL012W	447 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YHL044W	YHL044W	708 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YIR036W-A	YIR036W-A	402 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	MCR1	YKL150W	909 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YKE2	YLR200W	345 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	CDC123	YLR215C	1083 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	RPL16B	YNL069C	597 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	RPL20B	YOR312C	519 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	MRPL40	YPL173W	894 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	RRP15	YPR143W	753 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	RXT2	YBR095C	1293 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	MED8	YBR193C	672 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YBR287W	YBR287W	1284 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	NDT80	YHR124W	1884 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	NOP12	YOL041C	1380 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	BCK1	YJL095W	4437 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YER046W-A	YER046W-A	330 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YKL091C	YKL091C	933 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	TFB1	YDR311W	1929 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	SNQ2	YDR011W	4506 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	SLK19	YOR195W	2466 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	DYN1	YKR054C	12279 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	VTC3	YPL019C	2508 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	MIX14	YDR031W	366 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	RAV2	YDR202C	1056 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	SLD5	YDR489W	885 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YGR160W	YGR160W	612 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	MVB12	YGR206W	306 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YHR213W	YHR213W	597 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YAR062W	YAR062W	597 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	INP1	YMR204C	1263 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YDR261W-A	YDR261W-A	1317 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	SEN54	YPL083C	1404 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	BOI1	YBL085W	2943 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	JJJ2	YJL162C	1752 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YCR045W-A	YCR045W-A	351 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YDR442W	YDR442W	393 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	ATP20	YPR020W	348 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	TAO3	YIL129C	7131 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	VPS38	YLR360W	1320 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	SOK1	YDR006C	2706 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	NSA1	YGL111W	1392 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YAT2	YER024W	2772 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	RIM13	YMR154C	2184 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	URK1	YNR012W	1506 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	BAT1	YHR208W	1182 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	TPK3	YKL166C	1197 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	RPL20A	YMR242C	519 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	NGL1	YOL042W	1092 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YOL057W	YOL057W	2136 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	RGR1	YLR071C	3249 nt		3.09	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	BPT1	YLL015W	4680 nt		3.09	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	SEC26	YDR238C	2922 nt		3.09	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	ASI3	YNL008C	2031 nt		3.09	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	PSY2	YNL201C	2577 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	ERG11	YHR007C	1593 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	BIT61	YJL058C	1632 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	NSE4	YDL105W	1209 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	YPR1	YDR368W	939 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	RMD6	YEL072W	696 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	STE2	YFL026W	1296 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	RSR1	YGR152C	819 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	TCD1	YHR003C	1290 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	YLR217W	YLR217W	324 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	REC102	YLR329W	795 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	ATX1	YNL259C	222 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	CBP6	YBR120C	489 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	CDC37	YDR168W	1521 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	RPO41	YFL036W	4056 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	CAF120	YNL278W	3183 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	NAB3	YPL190C	2409 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	VMA8	YEL051W	771 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	YGR115C	YGR115C	780 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	SFT1	YKL006C-A	294 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	NBP1	YLR457C	960 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	YMR181C	YMR181C	465 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	GRE2	YOL151W	1029 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	snR189	snR189	189 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	MBA1	YBR185C	837 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	RAD18	YCR066W	1464 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	GUP1	YGL084C	1683 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	ARK1	YNL020C	1917 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	SRB4	YER022W	2064 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	UBP1	YDL122W	2430 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	AI2	Q0055	2565 nt		3.06	□□□□□ -1.92

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