Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms