Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms