Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms