Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FCGRTP55899 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms