Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP9P55211 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP9P55211 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP9P55211 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP9P55211 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP9P55211 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP9P55211 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP9P55211 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP9P55211 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP9P55211 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP9P55211 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP9P55211 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP9P55211 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP9P55211 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP9P55211 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP9P55211 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP9P55211 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP9P55211 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP9P55211 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP9P55211 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP9P55211 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP9P55211 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms