Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DAP3P51398 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DAP3P51398 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DAP3P51398 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DAP3P51398 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DAP3P51398 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DAP3P51398 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms