Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms