Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms