Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS9P46781 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS9P46781 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS9P46781 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS9P46781 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS9P46781 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS9P46781 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS9P46781 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS9P46781 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS9P46781 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS9P46781 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS9P46781 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS9P46781 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS9P46781 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS9P46781 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS9P46781 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS9P46781 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS9P46781 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS9P46781 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS9P46781 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS9P46781 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS9P46781 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS9P46781 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RPS9P46781 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS9P46781 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS9P46781 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS9P46781 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms