Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 BUD21YOR078W 645 nt3.63□□□□□ -1.83
VID28P40547 YMR018WYMR018W 1545 nt3.63□□□□□ -1.83
VID28P40547 FLO10YKR102W 3510 nt3.63□□□□□ -1.83
VID28P40547 KAR9YPL269W 1935 nt3.62□□□□□ -1.83
VID28P40547 GCN1YGL195W 8019 nt3.62□□□□□ -1.83
VID28P40547 BYE1YKL005C 1785 nt3.62□□□□□ -1.83
VID28P40547 RPL9AYGL147C 576 nt3.62□□□□□ -1.83
VID28P40547 YGR073CYGR073C 372 nt3.62□□□□□ -1.83
VID28P40547 COX23YHR116W 456 nt3.62□□□□□ -1.83
VID28P40547 YLR224WYLR224W 1110 nt3.62□□□□□ -1.83
VID28P40547 RIM9YMR063W 720 nt3.62□□□□□ -1.83
VID28P40547 EAP1YKL204W 1899 nt3.62□□□□□ -1.83
VID28P40547 SCY1YGL083W 2415 nt3.62□□□□□ -1.83
VID28P40547 DNM1YLL001W 2274 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 ARG2YJL071W 1725 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 RED1YLR263W 2484 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 MET10YFR030W 3108 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 CDC26YFR036W 375 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 PDS5YMR076C 3834 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 SAS2YMR127C 1017 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 CSI2YOL007C 1026 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 YBR051WYBR051W 351 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 PRM3YPL192C 402 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 YBR062CYBR062C 543 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 snR42snR42 351 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 SIZ1YDR409W 2715 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 SPT16YGL207W 3108 nt3.61□□□□□ -1.83
VID28P40547 SNU56YDR240C 1479 nt3.6□□□□□ -1.83
VID28P40547 MSH4YFL003C 2637 nt3.6□□□□□ -1.83
VID28P40547 YDR537CYDR537C 606 nt3.6□□□□□ -1.83
VID28P40547 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.6□□□□□ -1.83
VID28P40547 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.6□□□□□ -1.83
VID28P40547 YLR076CYLR076C 423 nt3.6□□□□□ -1.83
VID28P40547 RPL13BYMR142C 600 nt3.6□□□□□ -1.83
VID28P40547 SFM1YOR021C 642 nt3.6□□□□□ -1.83
VID28P40547 ATP25YMR098C 1839 nt3.6□□□□□ -1.83
VID28P40547 MAK5YBR142W 2322 nt3.6□□□□□ -1.83
VID28P40547 YDL050CYDL050C 372 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 HNT1YDL125C 477 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 AIM11YER093C-A 414 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 RPL1BYGL135W 654 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 YGR018CYGR018C 330 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 PET54YGR222W 882 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 YIR020CYIR020C 303 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 YKL063CYKL063C 504 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 RPL15AYLR029C 615 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 AFB1YLR040C 675 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 YPL142CYPL142C 318 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 MRPL40YPL173W 894 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 RPL1AYPL220W 654 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 YDR338CYDR338C 2088 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 FRE8YLR047C 2061 nt3.59□□□□□ -1.83
VID28P40547 TOP1YOL006C 2310 nt3.59□□□□□ -1.84
VID28P40547 YGR237CYGR237C 2358 nt3.59□□□□□ -1.84
VID28P40547 YHR080CYHR080C 4038 nt3.59□□□□□ -1.84
VID28P40547 TMA108YIL137C 2841 nt3.58□□□□□ -1.84
VID28P40547 EMI1YDR512C 564 nt3.58□□□□□ -1.84
VID28P40547 VFA1YER128W 612 nt3.58□□□□□ -1.84
VID28P40547 PDP3YLR455W 915 nt3.58□□□□□ -1.84
VID28P40547 PDR17YNL264C 1053 nt3.58□□□□□ -1.84
VID28P40547 YOR169CYOR169C 465 nt3.58□□□□□ -1.84
VID28P40547 CCM1YGR150C 2595 nt3.58□□□□□ -1.84
VID28P40547 SNA4YDL123W 423 nt3.57□□□□□ -1.84
VID28P40547 TMA64YDR117C 1698 nt3.57□□□□□ -1.84
VID28P40547 VEL1YGL258W 621 nt3.57□□□□□ -1.84
VID28P40547 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.57□□□□□ -1.84
VID28P40547 YLR171WYLR171W 390 nt3.57□□□□□ -1.84
VID28P40547 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt3.57□□□□□ -1.84
VID28P40547 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt3.57□□□□□ -1.84
VID28P40547 DSF2YBR007C 2211 nt3.57□□□□□ -1.84
VID28P40547 SVS1YPL163C 783 nt3.57□□□□□ -1.84
VID28P40547 YPR053CYPR053C 456 nt3.57□□□□□ -1.84
VID28P40547 STE6YKL209C 3873 nt3.57□□□□□ -1.84
VID28P40547 YRR1YOR162C 2433 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 GDS1YOR355W 1569 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 PEX1YKL197C 3132 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 UTP15YMR093W 1542 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 YDR149CYDR149C 708 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 RSM24YDR175C 960 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 YDR431WYDR431W 312 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 COX13YGL191W 390 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 SDO1YLR022C 753 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 ENV10YLR065C 546 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 YHC1YLR298C 696 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 PBI2YNL015W 228 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 RHO5YNL180C 996 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 snR17asnR17a 333 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 YPR012WYPR012W 255 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 EPL1YFL024C 2499 nt3.56□□□□□ -1.84
VID28P40547 YNL193WYNL193W 1677 nt3.55□□□□□ -1.84
VID28P40547 UBP5YER144C 2418 nt3.55□□□□□ -1.84
VID28P40547 UBP16YPL072W 1500 nt3.55□□□□□ -1.84
VID28P40547 FAA2YER015W 2235 nt3.55□□□□□ -1.84
VID28P40547 PEX10YDR265W 1014 nt3.55□□□□□ -1.84
VID28P40547 YER084W-AYER084W-A 513 nt3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.6 ms