Protein–RNA interactions for Protein: P38235

YBR053C, Uncharacterized protein YBR053C, yeast

Predictions only

Length 358 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBR053C	P38235	SRD1	YCR018C	666 nt		3.66	□□□□□ -1.82
YBR053C	P38235	IRC2	YDR112W	309 nt		3.66	□□□□□ -1.82
YBR053C	P38235	SDC1	YDR469W	528 nt		3.66	□□□□□ -1.82
YBR053C	P38235	MTC3	YGL226W	372 nt		3.66	□□□□□ -1.82
YBR053C	P38235	YKL083W	YKL083W	615 nt		3.66	□□□□□ -1.82
YBR053C	P38235	YPL225W	YPL225W	441 nt		3.66	□□□□□ -1.82
YBR053C	P38235	MSL5	YLR116W	1431 nt		3.66	□□□□□ -1.82
YBR053C	P38235	RDH54	YBR073W	2877 nt		3.66	□□□□□ -1.82
YBR053C	P38235	NUP133	YKR082W	3474 nt		3.66	□□□□□ -1.82
YBR053C	P38235	STI1	YOR027W	1770 nt		3.66	□□□□□ -1.82
YBR053C	P38235	PPZ1	YML016C	2079 nt		3.66	□□□□□ -1.82
YBR053C	P38235	SPT23	YKL020C	3249 nt		3.65	□□□□□ -1.82
YBR053C	P38235	TRX3	YCR083W	384 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	RPP1A	YDL081C	321 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	OPI6	YDL096C	327 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	ATP5	YDR298C	639 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	RPA12	YJR063W	378 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YLR076C	YLR076C	423 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YLR269C	YLR269C	351 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	PDR17	YNL264C	1053 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YBR032W	YBR032W	303 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	APC5	YOR249C	2058 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YJL132W	YJL132W	2253 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	OPT2	YPR194C	2634 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	RIM13	YMR154C	2184 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	TCO89	YPL180W	2400 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	HFD1	YMR110C	1599 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	TRS120	YDR407C	3870 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	TAF7	YMR227C	1773 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	MIP6	YHR015W	1980 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	ECO1	YFR027W	846 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	NBL1	YHR199C-A	222 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YJR079W	YJR079W	330 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	PKR1	YMR123W	369 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YMR141C	YMR141C	309 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	SRL1	YOR247W	633 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	IRC16	YPR038W	360 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	RPO21	YDL140C	5202 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	IMH1	YLR309C	2736 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	APE2	YKL157W	2859 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	EBS1	YDR206W	2655 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	RAD4	YER162C	2265 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	IRC3	YDR332W	2070 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YCR090C	YCR090C	549 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	RPS29B	YDL061C	171 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	FMP32	YFL046W	624 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YAL037W	YAL037W	804 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	PIN4	YBL051C	2007 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	PGS1	YCL004W	1566 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	NAT1	YDL040C	2565 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YRR1	YOR162C	2433 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	FMN1	YDR236C	657 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YGL074C	YGL074C	327 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	MVB12	YGR206W	306 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	MRPL38	YKL170W	417 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	ARV1	YLR242C	966 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	CGI121	YML036W	546 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YBL028C	YBL028C	321 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YMR031W-A	YMR031W-A	327 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	CDC33	YOL139C	642 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	RAD2	YGR258C	3096 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	SPE1	YKL184W	1401 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YLR177W	YLR177W	1887 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YEL075C	YEL075C	369 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	ABM1	YJR108W	372 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	RMP1	YLR145W	606 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YNL146C-A	YNL146C-A	195 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	RFC3	YNL290W	1023 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	COQ10	YOL008W	624 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	OM14	YBR230C	405 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	TRK1	YJL129C	3708 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	UTP15	YMR093W	1542 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YDL009C	YDL009C	324 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YDR431W	YDR431W	312 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YGL063C-A	YGL063C-A	150 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	FYV4	YHR059W	393 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YHR212C	YHR212C	336 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YAR060C	YAR060C	336 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	DYN3	YMR299C	939 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YAF9	YNL107W	681 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	AAR2	YBL074C	1068 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	POL4	YCR014C	1749 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YNR063W	YNR063W	1824 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	PRM15	YMR278W	1869 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	AVT7	YIL088C	1473 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	RPS18A	YDR450W	441 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YDR526C	YDR526C	471 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	DFG10	YIL049W	762 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YIR014W	YIR014W	729 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YKL118W	YKL118W	312 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	GTT2	YLL060C	702 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	RPL16B	YNL069C	597 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	YOR282W	YOR282W	321 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	BEM4	YPL161C	1902 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	ZDS1	YMR273C	2748 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YBR053C	P38235	DBF20	YPR111W	1695 nt		3.59	□□□□□ -1.84
YBR053C	P38235	VAC14	YLR386W	2643 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YBR053C	P38235	SNA4	YDL123W	423 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YBR053C	P38235	MAM33	YIL070C	801 nt		3.58	□□□□□ -1.84

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