Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP62P37198 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP62P37198 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP62P37198 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP62P37198 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP62P37198 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP62P37198 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms