Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms