Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB2P35606 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
COPB2P35606 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COPB2P35606 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB2P35606 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB2P35606 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB2P35606 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB2P35606 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB2P35606 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB2P35606 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB2P35606 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB2P35606 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB2P35606 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB2P35606 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB2P35606 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPB2P35606 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPB2P35606 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPB2P35606 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPB2P35606 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPB2P35606 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPB2P35606 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPB2P35606 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COPB2P35606 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COPB2P35606 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPB2P35606 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPB2P35606 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPB2P35606 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPB2P35606 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPB2P35606 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPB2P35606 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPB2P35606 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPB2P35606 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPB2P35606 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPB2P35606 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPB2P35606 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPB2P35606 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPB2P35606 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPB2P35606 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPB2P35606 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPB2P35606 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPB2P35606 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms