Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 RSF1-IT1-201ENST00000528233 632 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 BX005214.2-201ENST00000423499 1077 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 OR4B1-201ENST00000309562 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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