Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms