Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms