Protein–RNA interactions for Protein: P28004

PRP45, Pre-mRNA-processing protein 45, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45P28004 LDS2YOL047C 1071 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP45P28004 MPD2YOL088C 834 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP45P28004 VAM10YOR068C 345 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP45P28004 NEL1YHR035W 1893 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP45P28004 FLO10YKR102W 3510 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP45P28004 PMR1YGL167C 2853 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP45P28004 CHS2YBR038W 2892 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP45P28004 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP45P28004 ABP140YOR239W 1887 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP45P28004 FRQ1YDR373W 573 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP45P28004 FMP10YER182W 735 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP45P28004 YGR228WYGR228W 345 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP45P28004 FYV7YLR068W 456 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP45P28004 RPS16AYMR143W 432 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP45P28004 NOP12YOL041C 1380 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP45P28004 YPL150WYPL150W 2706 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP45P28004 NMA111YNL123W 2994 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP45P28004 YDR089WYDR089W 2610 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP45P28004 YDR115WYDR115W 318 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP45P28004 MVB12YGR206W 306 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP45P28004 EAF6YJR082C 342 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP45P28004 DYN3YMR299C 939 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP45P28004 YNL122CYNL122C 348 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP45P28004 YNL150WYNL150W 408 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP45P28004 YNL184CYNL184C 327 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP45P28004 RIM13YMR154C 2184 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP45P28004 POL4YCR014C 1749 nt3.53□□□□□ -1.85
PRP45P28004 SWI1YPL016W 3945 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP45P28004 SLK19YOR195W 2466 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP45P28004 IOC2YLR095C 2439 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP45P28004 ERG11YHR007C 1593 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP45P28004 FUN30YAL019W 3396 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP45P28004 FAR7YFR008W 666 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP45P28004 SWS2YNL081C 432 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YDL050CYDL050C 372 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YDL187CYDL187C 330 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP45P28004 ARF1YDL192W 546 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP45P28004 PRM8YGL053W 714 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP45P28004 SCEIQ0160 708 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YHR212CYHR212C 336 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YIL175WYIL175W 318 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YAR060CYAR060C 336 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP45P28004 TCB2YNL087W 3537 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YGL039WYGL039W 1047 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YGL082WYGL082W 1146 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP45P28004 PCL5YHR071W 690 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP45P28004 VPS63YLR261C 327 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP45P28004 PDP3YLR455W 915 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP45P28004 MBA1YBR185C 837 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP45P28004 HEF3YNL014W 3135 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP45P28004 FKS3YMR306W 5358 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YJL132WYJL132W 2253 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP45P28004 UBP1YDL122W 2430 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP45P28004 BAR1YIL015W 1764 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP45P28004 SEC15YGL233W 2733 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP45P28004 TIF4631YGR162W 2859 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP45P28004 MXR1YER042W 555 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YGL159WYGL159W 1113 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP45P28004 AYT1YLL063C 1425 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP45P28004 TAF6YGL112C 1551 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YLR177WYLR177W 1887 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP45P28004 ERB1YMR049C 2424 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP45P28004 SRD1YCR018C 666 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP45P28004 AIM11YER093C-A 414 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP45P28004 Q0142Q0142 177 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP45P28004 EMC6YLL014W 327 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP45P28004 ATX1YNL259C 222 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YPL205CYPL205C 345 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP45P28004 BRE5YNR051C 1548 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP45P28004 MPS1YDL028C 2295 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 GAL80YML051W 1308 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 RED1YLR263W 2484 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 SKO1YNL167C 1944 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 HMLALPHA2YCL067C 633 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 snR56snR56 88 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 MATALPHA2YCR039C 633 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 RPL11BYGR085C 525 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YAL037WYAL037W 804 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 PHD1YKL043W 1101 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 IES3YLR052W 753 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YLR297WYLR297W 390 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 JIP3YLR331C 378 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 CSI2YOL007C 1026 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 YOL114CYOL114C 609 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 LTP1YPR073C 486 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 RPL11AYPR102C 525 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 SLP1YOR154W 1764 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 VTC3YPL019C 2508 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 STP2YHR006W 1626 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 MUB1YMR100W 1863 nt3.47□□□□□ -1.85
PRP45P28004 AVT5YBL089W 1380 nt3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.8 ms