Protein–RNA interactions for Protein: P25582

SPB1, 27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPB1P25582 KHA1YJL094C 2622 nt2.96□□□□□ -1.94
SPB1P25582 TAF2YCR042C 4224 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 PMR1YGL167C 2853 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 SAE2YGL175C 1038 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 RPL11BYGR085C 525 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 YHR054CYHR054C 1065 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 SRL3YKR091W 741 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 ECI1YLR284C 843 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 YLR297WYLR297W 390 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 RPL11AYPR102C 525 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 CUR1YPR158W 759 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 TIM12YBR091C 330 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 MDM1YML104C 3384 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 AI2Q0055 2565 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 ATG13YPR185W 2217 nt2.95□□□□□ -1.94
SPB1P25582 AVT2YEL064C 1443 nt2.94□□□□□ -1.94
SPB1P25582 MOT1YPL082C 5604 nt2.94□□□□□ -1.94
SPB1P25582 RPA190YOR341W 4995 nt2.94□□□□□ -1.94
SPB1P25582 NTF2YER009W 378 nt2.94□□□□□ -1.94
SPB1P25582 PCL5YHR071W 690 nt2.94□□□□□ -1.94
SPB1P25582 YET1YKL065C 621 nt2.94□□□□□ -1.94
SPB1P25582 ADI1YMR009W 540 nt2.94□□□□□ -1.94
SPB1P25582 RPL16BYNL069C 597 nt2.94□□□□□ -1.94
SPB1P25582 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.94□□□□□ -1.94
SPB1P25582 YPL107WYPL107W 747 nt2.94□□□□□ -1.94
SPB1P25582 YRO2YBR054W 1035 nt2.94□□□□□ -1.94
SPB1P25582 POL3YDL102W 3294 nt2.94□□□□□ -1.94
SPB1P25582 SRB8YCR081W 4284 nt2.93□□□□□ -1.94
SPB1P25582 DBP7YKR024C 2229 nt2.93□□□□□ -1.94
SPB1P25582 ATP22YDR350C 2055 nt2.93□□□□□ -1.94
SPB1P25582 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt2.93□□□□□ -1.94
SPB1P25582 SDH3YKL141W 597 nt2.93□□□□□ -1.94
SPB1P25582 MCR1YKL150W 909 nt2.93□□□□□ -1.94
SPB1P25582 MST28YAR033W 705 nt2.93□□□□□ -1.94
SPB1P25582 CDC123YLR215C 1083 nt2.93□□□□□ -1.94
SPB1P25582 GIM3YNL153C 390 nt2.93□□□□□ -1.94
SPB1P25582 CSI2YOL007C 1026 nt2.93□□□□□ -1.94
SPB1P25582 ERG11YHR007C 1593 nt2.92□□□□□ -1.94
SPB1P25582 YCT1YLL055W 1596 nt2.92□□□□□ -1.94
SPB1P25582 YKL075CYKL075C 1353 nt2.92□□□□□ -1.94
SPB1P25582 PBP4YDL053C 558 nt2.92□□□□□ -1.94
SPB1P25582 FIN1YDR130C 876 nt2.92□□□□□ -1.94
SPB1P25582 SNO3YFL060C 669 nt2.92□□□□□ -1.94
SPB1P25582 SNO2YNL334C 669 nt2.92□□□□□ -1.94
SPB1P25582 STE6YKL209C 3873 nt2.92□□□□□ -1.94
SPB1P25582 STI1YOR027W 1770 nt2.92□□□□□ -1.94
SPB1P25582 TFC4YGR047C 3078 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 BOI1YBL085W 2943 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 MIC19YFR011C 513 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 MST27YGL051W 705 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 PPX1YHR201C 1194 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 PRP21YJL203W 843 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 ATG38YLR211C 681 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 MRPL16YBL038W 699 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 YOL029CYOL029C 606 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 AFT2YPL202C 1251 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 YPR203WYPR203W 309 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 SEC66YBR171W 621 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 NTC20YBR188C 423 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 SWC4YGR002C 1431 nt2.91□□□□□ -1.94
SPB1P25582 MET6YER091C 2304 nt2.9□□□□□ -1.95
SPB1P25582 HPA3YEL066W 540 nt2.9□□□□□ -1.95
SPB1P25582 MRM2YGL136C 963 nt2.9□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.9□□□□□ -1.95
SPB1P25582 CPR7YJR032W 1182 nt2.9□□□□□ -1.95
SPB1P25582 VPS63YLR261C 327 nt2.9□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YPR147CYPR147C 915 nt2.9□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YPR153WYPR153W 423 nt2.9□□□□□ -1.95
SPB1P25582 ASI3YNL008C 2031 nt2.9□□□□□ -1.95
SPB1P25582 SRB4YER022W 2064 nt2.89□□□□□ -1.95
SPB1P25582 CEP3YMR168C 1827 nt2.89□□□□□ -1.95
SPB1P25582 SNA4YDL123W 423 nt2.89□□□□□ -1.95
SPB1P25582 PAM1YDR251W 2493 nt2.89□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YGR107WYGR107W 450 nt2.89□□□□□ -1.95
SPB1P25582 ASG7YJL170C 630 nt2.89□□□□□ -1.95
SPB1P25582 RPL17BYJL177W 555 nt2.89□□□□□ -1.95
SPB1P25582 ECM9YKR004C 1134 nt2.89□□□□□ -1.95
SPB1P25582 SGT1YOR057W 1188 nt2.89□□□□□ -1.95
SPB1P25582 JSN1YJR091C 3276 nt2.89□□□□□ -1.95
SPB1P25582 JJJ2YJL162C 1752 nt2.89□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YJL132WYJL132W 2253 nt2.88□□□□□ -1.95
SPB1P25582 PRP38YGR075C 729 nt2.88□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YLR271WYLR271W 825 nt2.88□□□□□ -1.95
SPB1P25582 MIX23YBL107C 591 nt2.88□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.88□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YLR278CYLR278C 4026 nt2.88□□□□□ -1.95
SPB1P25582 HEH2YDR458C 1992 nt2.87□□□□□ -1.95
SPB1P25582 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.87□□□□□ -1.95
SPB1P25582 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.87□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.87□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.87□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.87□□□□□ -1.95
SPB1P25582 RPL23AYBL087C 414 nt2.87□□□□□ -1.95
SPB1P25582 SHS1YDL225W 1656 nt2.87□□□□□ -1.95
SPB1P25582 SEC7YDR170C 6030 nt2.87□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YDR338CYDR338C 2088 nt2.87□□□□□ -1.95
SPB1P25582 BPT1YLL015W 4680 nt2.87□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YDL163WYDL163W 303 nt2.86□□□□□ -1.95
SPB1P25582 DAD1YDR016C 285 nt2.86□□□□□ -1.95
SPB1P25582 MRH1YDR033W 963 nt2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.1 ms