Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA1P25391 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms