Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms