Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSR1P21757 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSR1P21757 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSR1P21757 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSR1P21757 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSR1P21757 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSR1P21757 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSR1P21757 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSR1P21757 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSR1P21757 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSR1P21757 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSR1P21757 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSR1P21757 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSR1P21757 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSR1P21757 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSR1P21757 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSR1P21757 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSR1P21757 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSR1P21757 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSR1P21757 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSR1P21757 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSR1P21757 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSR1P21757 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSR1P21757 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSR1P21757 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSR1P21757 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSR1P21757 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSR1P21757 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSR1P21757 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSR1P21757 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSR1P21757 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSR1P21757 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSR1P21757 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MSR1P21757 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSR1P21757 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MSR1P21757 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MSR1P21757 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MSR1P21757 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms