Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD58P19256 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD58P19256 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD58P19256 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD58P19256 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD58P19256 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD58P19256 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD58P19256 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD58P19256 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD58P19256 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD58P19256 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD58P19256 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD58P19256 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD58P19256 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD58P19256 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD58P19256 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD58P19256 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD58P19256 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD58P19256 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD58P19256 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms