Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI1P19237 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms