Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOT1P17174 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOT1P17174 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOT1P17174 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOT1P17174 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOT1P17174 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOT1P17174 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOT1P17174 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOT1P17174 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOT1P17174 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOT1P17174 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOT1P17174 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOT1P17174 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOT1P17174 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOT1P17174 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOT1P17174 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOT1P17174 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOT1P17174 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOT1P17174 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOT1P17174 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOT1P17174 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms