Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms