Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD28P10747 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD28P10747 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD28P10747 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD28P10747 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms