Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf88P0DMB2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms