Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD1P0DJD0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms