Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms