Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB1P08034 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB1P08034 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB1P08034 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB1P08034 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB1P08034 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB1P08034 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB1P08034 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB1P08034 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms