Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFMP07197 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEFMP07197 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEFMP07197 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFMP07197 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFMP07197 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFMP07197 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFMP07197 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFMP07197 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFMP07197 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFMP07197 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFMP07197 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFMP07197 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFMP07197 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFMP07197 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFMP07197 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFMP07197 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFMP07197 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFMP07197 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFMP07197 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms