Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms