Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EGFRP00533 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EGFRP00533 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EGFRP00533 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EGFRP00533 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EGFRP00533 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EGFRP00533 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EGFRP00533 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EGFRP00533 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms