Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CLDN9O95484 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CLDN9O95484 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CLDN9O95484 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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CLDN9O95484 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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CLDN9O95484 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN9O95484 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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