Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms