Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP5O75197 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP5O75197 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP5O75197 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP5O75197 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP5O75197 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP5O75197 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP5O75197 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP5O75197 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP5O75197 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP5O75197 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP5O75197 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP5O75197 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP5O75197 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP5O75197 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP5O75197 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP5O75197 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP5O75197 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP5O75197 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP5O75197 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP5O75197 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP5O75197 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP5O75197 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP5O75197 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP5O75197 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP5O75197 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP5O75197 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP5O75197 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP5O75197 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP5O75197 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP5O75197 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP5O75197 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP5O75197 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP5O75197 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP5O75197 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP5O75197 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP5O75197 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP5O75197 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP5O75197 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP5O75197 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP5O75197 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP5O75197 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRP5O75197 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRP5O75197 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRP5O75197 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
LRP5O75197 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRP5O75197 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
LRP5O75197 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRP5O75197 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP5O75197 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP5O75197 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP5O75197 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP5O75197 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP5O75197 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP5O75197 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP5O75197 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP5O75197 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP5O75197 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP5O75197 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP5O75197 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRP5O75197 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRP5O75197 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRP5O75197 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRP5O75197 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRP5O75197 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRP5O75197 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRP5O75197 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP5O75197 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms